Presentations

International

  • Eiji Yamamoto, “Heterogeneous Diffusion of a Peripheral Protein on a Lipid Membrane Surface”, Workshop on Stochasticity and Fluctuations in Small Systems, Pohang, Korea, 1, December 2016. (invited)
  • Eiji Yamamoto, “Anomalous dynamics of biomolecules around cell membranes: Molecular dynamics simulation study”, 2016 France-Japan Workshop on Nanoscale Electron-Photon Interactions in Grenoble, Grenoble, France, 25, October 2016.
  • Eiji Yamamoto, Antreas C. Kalli, Takuma Akimoto, Kenji Yasuoka, and Mark S. P. Sansom, “Anomalous Dynamics of Pleckstrin Homology Domains on Lipid Membrane Surfaces”, Biophysical Society 59th Annual Meeting, Baltimore, Maryland, 9, February 2015.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Origin of 1/f fluctuations of number of water molecules on lipid membrane surfaces”, International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling: Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30), Tokyo, Japan, 11, November 2014.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “1/f noise in hydration dynamics on lipid membrane surfaces”, Molecular Simulation Studies in Material and Biological Sciences, Moscow, Russia, 21, September 2014.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “1/f fluctuations of amino acids generate non-Poisson water transportation in AQP1”, Biophysical Society 58th Annual Meeting, San Francisco, California, 18, February 2014.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Molecular Dynamics Simulation on Conformational Fluctuation and Water Transport within AQP1”, 3rd International Conference on Molecular Simulation (ICMS2013), Kobe, Japan, 19, November 2013.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Water Transportation in Aquaporin-1 Follows non-Poisson Statics”, 1st International Symposium on Computational Materials and Biological Sciences, Tokyo, Japan, 12, September 2013.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Origin of Anomalous Feature of Water Molecules on Membrane Surface”, 16th International Conference on the Properties of Water & Steam, London, United Kingdom, 3, September 2013.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Power-Law Trappings Cause Anomalous Diffusions of Water Molecules on Membrane Surfaces”, Biophysical Society 57th Annual Meeting, Philadelphia, Pennsylvania, 3, February 2013.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Molecular Dynamics Simulations on Anomalous Dynamics of Water, Xenon, and Lipid Bilayer”, Nagoya Symposium -Frontiers in Structural Physiology-, Nagoya, Japan, 22-24, January 2013.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Dynamics of Water Molecules around a Lipid Bilayer”, International Workshop MSSMBS-2012, Moscow, Russia, 10, September 2012.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka, and Masato Yasui, “A Possible Mechanism on Pressure Reversal of General Anesthesia in Membrane”, Biophysical Society 56th Annual Meeting, San Diego, California, 26, February 2012.

Invited Talk

  • 山本詠士, “生体膜表面での脂質分子との相互作用がタンパク質の拡散性に与える影響”, ソフトマターを中心とした材料科学の基礎と応用, 京都,2017年3月21-22日.
  • 山本詠士, “分子動力学シミュレーションによる細胞膜近傍での生体分子の拡散現象の解明”, 第379回CBI学会研究講演会, 東京,2017年1月27日.
  • 山本詠士, “細胞膜で観測される1/fゆらぎは生物学的に重要か?”, 東京薬科大学 理論系合同セミナー, 東京, 2015年1月15日.
  • 山本詠士, “細胞膜/水分子系の分子動力学シミュレーション”, 第112回水科学研究会, 東京, 2011年12月17日.

Domestic

  • 山本詠士,秋元琢磨,Antreas C. Kalli,Mark S. P. Sansom,泰岡顕治, “表在性膜タンパク質の脂質膜上での不均一拡散”, 第29回分子シミュレーション討論会, 大阪, 2016年12月2日.
  • 山本詠士,秋元琢磨,Antreas C. Kalli,Mark S. P. Sansom,泰岡顕治, “表在性膜タンパク質の脂質膜上での異常拡散”,第37回日本熱物性シンポジウム,岡山,2016年11月28日.
  • Eiji Yamamoto, Antreas C. Kalli, Takuma Akimoto, Mark S.P. Sansom, and Kenji Yasuoka, “Investigating interactions and dynamics of pleckstrin homology domains on a lipid membrane surface”,第54回生物物理学会年会,つくば,2016年11月25日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治, “アクアポリンの水分子透過に関する分子シミュレーション”, 第29回分子シミュレーション討論会, 新潟, 2015年12月1日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治, “アクアポリン細孔口での水分子とイオンの振る舞い”, 第36回日本熱物性シンポジウム, 仙台, 2015年10月19日.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Water dynamics at channel entrance of aquaporin 1”, 第53回生物物理学会年会, 金沢, 2015年9月15日.
  • 山本詠士, Antreas C. Kalli, 秋元琢磨, Mark S. P. Sansom, 泰岡顕治, “Pleckstrin-homology (PH) ドメインと 細胞膜との相互作用”, 第28回分子シミュレーション討論会, 仙台, 2014年11月12日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 安井正人, 泰岡顕治, “脂質二重膜表面の水分子の個数の 1/f ゆらぎ”, 日本機械学会熱工学コンファレンス 2014, 東京, 2014年11月9日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治, “アクアポリン内部の水分子透過に関する分子シミュレーション”, 第34回日本熱物性シンポジウム, 富山, 2013年11月21日.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Aging of water molecules on cell membrane surfaces”, 第51回生物物理学会年会, 京都, 2013年10月29日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治, “脂質二重膜周りの水分子の異常拡散”, 第26回分子シミュレーション討論会, 福岡, 2012年11月26日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治, “分子動力学シミュレーションによる細胞膜周りの水分子の温度依存性の解析”, 第33回日本熱物性シンポジウム, 大阪, 2012年10月4日.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Masato Yasui, and Kenji Yasuoka, “Mean Exit Time Analysis about Water Molecules around Membrane Surfaces”, 第50回生物物理学会年会, 名古屋, 2012年9月22日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 安井正人, 泰岡顕治, “分子動力学シミュレーションによる脂質二重膜周りの水分子のダイナミクスの解析”, 第17回計算工学講演会, 京都, 2012年5月30日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 泰岡顕治, 安井正人, “外圧の増加が脂質二重膜内のキセノン分子へ与える影響”, 第25回分子シミュレーション討論会, 大岡山, 2011年12月5日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 泰岡顕治, 安井正人, “水/キセノン/脂質二重膜の分子動力学シミュレーション”, 第32回日本熱物性シンポジウム, 横浜, 2011年11月23日.
  • Eiji Yamamoto, Takuma Akimoto, Yoshinori Hirano, Kenji Yasuoka, and Masato Yasui, “Molecular Dynamics Simulations on Pressure Reversal of General Anesthesia in a Lipid Bilayer”, 第49回生物物理学会年会, 姫路, 2011年9月16日.
  • 山本詠士, 秋元琢磨, 平野秀典, 泰岡顕治, 安井正人, “キセノン分子と圧力が脂質二重膜に与える影響に関する分子動力学計算”, 第24回分子シミュレーション討論会, 福井, 2010年11月24日.